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Scoperto il genoma della fragolina di bosco

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Coordinato dall’università della Florida, il progetto di ricerca è durato due anni ed è stato realizzato da un consorzio internazionale formato da 37 istituzioni scientifiche. Nello specifico, l’attività ha coinvolto 25 centri di ricerca nordamericani, due sudafricani, uno norvegese, uno francese, due spagnoli, due cileni, uno israeliano, e uno italiano, l’Istituto Agrario di San Michele all’Adige, già protagonista del sequenziamento del genoma della vite e del melo.

I risultati sono riportati in un articolo scientifico firmato da 71 autori, pubblicato on line sulla prestigiosa rivista Nature Genetics, il mensile scientifico del gruppo Nature dedicato alle eccellenze nel settore genetico e genomico.

I geni identificati della fragolina di bosco, varietà Hawaii4, sono 34.809 ed è il più piccolo genoma di pianta coltivata finora decifrato. Grazie a questo risultato si potrà sostenere e potenziare la ricerca nel campo della fragola e dei piccoli frutti per ottenere in modo rapido nuove varietà di fragola.

I tempi del miglioramento genetico convenzionale saranno dunque velocizzati per ottenere piante in grado di produrre frutti più salubri e gustosi e che si difendono da sole dalle malattie e dagli insetti, riducendo così gli interventi agronomici in campagna e realizzando una frutticoltura più sostenibile.

 “Il sequenziamento del genoma della fragola, come lo è stato per vite e melo – spiegano gli autori italiani Roberto Viola, dirigente del Centro ricerca e innovazione, Riccardo Velasco, coordinatore dell’area agricoltura del CRI, e la ricercatrice Michela Troggio – amplifica di almeno mille volte le nostre conoscenze relativamente a questa importante pianta agraria, in particolare le sue proprietà nutrizionali, l’impatto ambientale, l’esplorazione della biodiversità, gli studi filogenetici ed evolutivi”.

Il genoma della fragola ora, dunque, non è più un segreto e le sequenze del DNA sono disponibili da gennaio sulle banche dati internazionali, liberamente consultabili da parte della comunità scientifica.

Nel corso del 2008 e 2009 sono state prodotte le sequenze del DNA di fragola (circa 8 miliardi di nucleotidi sequenziati) e nel corso di quest’anno i ricercatori hanno effettuato l’assemblaggio e la ricostruzione del contenuto ordinato dei geni dei 7 cromosomi della fragola. Le sequenze coprono 40 volte il genoma della fragola, con oltre il 90% del genoma assemblato nei cromosomi e 34.809 geni ancorati ad una precisa posizione dei cromosomi.

La fragola sequenziata è la fragolina di bosco (Fragaria vesca), la quale ha contribuito per un quarto al genoma della fragola che troviamo sulle nostre tavole (Fragaria x ananassa). Il progetto ha permesso, inoltre, di identificare le relazioni tra i cromosomi della fragola e i cromosomi del pesco – entrambe sono della famiglia botanica delle Rosaceae, come del resto il melo – e le loro relazioni filogenetiche.

I “numeri” del genoma della fragola:

• 8 miliardi i nucleotidi sequenziati

• 7 i cromosomi della fragola

• 210 milioni le basi di Dna

• 34.809 i geni identificati

di O.O.

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